Объектом данного вида исследования, прежде всего, является документация организации (предприятия), которая содержит сведения о ее финансовой (кредитной) деятельности, то есть документы, иллюстрирующие направления движения финансов, финансовые источники, область затрат и результаты финансовой активности. К таким документам относятся:
Особенность отбора материалов, представляемых для проведения финансово-экономической экспертизы, заключается в том, что они должны содержать наиболее полные данные, комплексным и всесторонним образом характеризующие балансовые взаимосвязи движения средств по счетам. В случае, если в наличии не имеется журналов-ордеров или главной книги, для проведения исследования могут быть представлены данные, полученные из надлежащим образом подобранных и обработанных первичных бухгалтерских документов. Например, все имеющиеся платежные поручения группируются в хронологическом порядке, затем к ним прикладываются товарно-транспортные накладные, счета-фактуры и прочие документы, необходимые для отслеживания движения денежных потоков. Банковские выписки должны находиться в строгом соответствии с регистрами учета и балансовыми данными банка.
Финансово-экономическая экспертиза в процессе анализа бухгалтерских счетов может выявить факты фальсификации первичных бухгалтерских документов. Однако для получения подобной информации необходимо получить наиболее полный комплект документов, отражающий все финансовые связи исследуемого предприятия. Анализ финансовых результатов хозяйственной деятельности субъекта, подвергаемого экспертизе, рассматривает не процедуру формирования документации, а ее непосредственную финансовую сущность, которая оценивается с точки зрения категорий прибыли, рентабельности, себестоимости, структуры показателей и выявляемых в ней противоречий.